Il Museo San Procolo è stato aperto nel 2006 come aggiunta alla chiesa di San Procolo. Il percorso museale si snoda attraverso le epoche della tarda antichità, dell' alto e del basso Medioevo e del drammatico periodo della Guerra dei Trent'anni, segnato da una devastante epidemia di febbre petecchiale. Brevi filmati e reperti archeologici di Naturno illustrano l’epoca. Le tombe del periodo del tifo del XVII secolo mostrano chiaramente la ferocia con cui la malattia è scoppiata sulla popolazione locale e ha devastato intere aree del paese. La sezione antropologica del museo è dedicata allo studio delle ossa e a ciò che ci dicono sulle condizioni di vita della gente. Inoltre, il museo contiene gli affreschi gotici rimossi della chiesa di San Procolo.

La chiesa di San Procolo e il Museo San Procolo formano così un'unità e insieme danno vita a 1500 anni di storia a Naturno.